Многочисленные труды по истории, этнографии, фольклору края, а также работы по статистике, народному об-разованию, медицине по праву ставят Василия Никифоровича в один ряд с известными краеведами, внесшими весомый вклад в изучение Среднего Урала, такими как А. А. Дмитриев, Д. Д. Смышляев, Н. К. Чупин. С 1876 г. — инспектор народных училищ Пермской губернии, посетил все школы Екатеринбургского уезда. Главный его труд — “Пермская летопись” в 7 томах, за которую Шишонко получил Большую серебряную медаль на Екате-ринбургской научно-промышленной выставке (1887). Писатель Д. Н. Мамин-Сибиряк называл В. Н. Шишонко “пермским Нестором летописцем”.
Апкаримова, Е. Ю. Шишонко Василий Никифорович (1831—1889) / Е. Ю. Апкаримова // Историки Урала XVIII—XX вв. — Екатеринбург, 2003. — С. 424—425 : портр.
Пирогова, Е. П. Шишонко Василий Никифорович (1831—1889) / Е. П. Пирогова // Календарь знаменательных и памятных дат. Свердловская область, 2001 / Свердл. обл. универс. науч. б-ка им. В. Г. Белинского. — Екатеринбург, 2000. — С. 97—100.
Пикулева, С. В. Шишонко Василий Никифорович / С. В. Пикулева // Уральская историческая энциклопедия. — Изд. 2-е, перераб. и доп. — Екатеринбург, 2000. — С. 615.
Василий Никифорович Шишонко // Летопись Прикамья. Ч.1 : 1324—1917 / Перм. обл. гос. б-ка им. А. М. Горького. — Пермь, 1997. — С. 68—70. — [В тексте дата рождения 14(2).08.1831].