Родился в г. Ростов-на Дону. Окончил Московский государственный университет (1872).
С именем Василия Михайловича связано развитие акушерства и гинекологии на Урале, история НИИ Охраны материнства и младенчества. В течение 26 лет он заведовал Екатеринбургским родильным домом с 1879 по 1905 гг. Впервые внедрил на Урале методику асептического проведения нормальных родов. С 1889 г. — член-учредитель Уральского медицинского общества, с 1907 по 1911 гг. он возглавлял это общество. Дважды избирался членом Екатеринбургской городской Думы (1898, 1906).
Голикова С. В. Екатеринбургский родильный дом : [история] // Екатеринбург: Рекорды и достижения. 2007. — 2007. — С. 60—61 : ил.
Василий Михайлович Онуфриев : [земский врач, акушер] // Здравоохранение Свердловской области: Традиции лидерства. — Екатеринбург, 2009. — С. 10 : портр.
Хайдуков К. С. Онуфриев Василий Михайлович // Екатеринбург : энциклопедия. — Екатеринбург, 2002. — С. 409.
Черданцева Г. А. ГУ “Уральский научно-исследовательский институт охраны материнства и младенчества Министерства здравоохранения Российской Федерации” // Уральский Федеральный Округ : справочник. — Екатеринбург, 2002. — С. 86—87.
Селезнева В. Т. : [Онуфриев Василий Михайлович] // Очерки по истории медицины в Пермской губернии. — Пермь, 1997. — С. 60—61.
