Родился в Нижнем Тагиле.

Раскольник беспоповщической секты (поморец). Крепостной Нижне-Тагильского завода. Иконописец. Мастер и учитель живописи лакированных расписных изделий. Первые навыки по росписи лакированных изделий с детских лет он получал в мастерской своего отца. Имел, как и отец, специальную мастерскую по росписи лакированных железных изделий и много учеников. Живописные работы в основном выполнялись по заказам. До нашего времени сохранилось расписное изделие из меди — столик для хранения жалованных грамот на дворянство Демидовых (1786). Особенностью и ценностью столика является роспись на его столешнице, выполненная Федором Андреевичем совместно с братом Вавилой Андреевичем. В октябре 1785, в связи с отъездом Вавилы Андреевича в Москву, совместная работа с братом прервалась и была завершена Федором Андреевичем и его учениками.

В декабре 1780 г. по заказу Н. Н. Демидова Федором Андреевичем и Вавилой Андреевичем Худояровыми из зеленой меди, покрытые лаком, были сделаны столики. Затем заводчик заказал для своего нового кабинета в Москве "обойные плитки", покрытые "белым лаком", и на одних — разные цветы, птички, жихали или бабочки, а на других — скоробеи или жуки. В 1784 г. Худояровы выполняли росписи "под китайскую" дощечек для одной из комнат Слободского дома Демидовых в Москве. Демидов отметил, что вылакированные художниками Худояровыми кабинетные дощечки выработаны весьма хорошо и, как поощрение, послал Федору Андреевичу и Вавиле Андреевичу на кафтан сукна, по кушаку и шапке.

Федор Андреевич, как и его отец, был мастером живописи, прекрасно знающий свое ремесло. У него было много учеников.

Сыновья от первого брака не продолжали семейных традиций, зато дети от второго брака - Павел, Исаак, Степан — оставили ярчайший след в развитии художественной культуры на Урале.