Родился в Екатеринбурге (Свердловске), в семье врача И. Неизвестного и писателя Б. А. Дижур. Участник Великой Отечественной войны, был тяжело ранен. Учился в Академии искусств, Институте им. Сурикова, на факультете философии Московского университета. Автор скульптур: «Маска скорби», «Война — это», «Роботы и полуроботы»; иллюстраций к произведениям Достоевского, Данте и др. Награжден орденами Красного Знамени (1945), «За заслуги перед Отечеством» (1986), Почета (2000). Живет в Нью-Йорке (США). Профессор философии Колумбийского университета, действительный член Шведской Королевской академии наук, Нью-Йоркской академии наук. В Швеции открыт музей Э. И. Неизвестного.
Музею — быть! : [музей Э. Неизвестного в Екатеринбурге] // Аргументы и факты-Урал. — Москва, 2013. — 27 февр. —5 марта (№ 9). — С. 30.
Мосин А. Г. «...Кто мы, откуда мы?» // Наука. Общество. Человек. — 2008. — № 4 (26). — С. 175—183 : фот.
Блинов В. Известность Неизвестного // Город посредине России : Екатеринбург. Свердловск. Екатеринбург : культур.-ист. очерки / Николай Корепанов, Владимир Блинов. — Екатеринбург, 2006. — С. 234—248 : ил.
Белянкин Г. Эрнст Неизвестный // Я и город. Доминанта моей жизни / Геннадий Белянкин. — Екатеринбург, 2005. — С. 195—198 : ил.
Мурзина И. Я. Творчество Э. Неизвестного // Художественная культура Урала / И. Я. Мурзина. — Екатеринбург, 2003. — С. 274—279 : ил.